Film počinje tako što se glavni likovi iz prethodnih filmova, Alex lav, Marty zebra, Gloria hijena, Melman žirafa i Princeza Fiona, koji su sada postali medijski poznati kao "Zvijezde Madagaskara", započinju svoje novo putovanje kroz Europu kao dio cirkusa. Međutim, stvari uskoro postaju komplicirane kada njihov cirkus postaje predmetom interesa ruskog lovca na životinje, Vitalija.