Horton, conmovido por la existencia de estos seres diminutos, decide protegerlos de los peligros que los rodean, incluyendo a un malvado zoólogo llamado Ned McDodd, que busca capturar a Horton para estudiarlo. A medida que Horton se adentra en el mundo de los Qui, conoce a una Qui llamada Sophie y juntos emprenden una emocionante aventura para salvar a su mundo y demostrar que incluso los seres más pequeños merecen respeto y consideración.